Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKBP12277 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKBP12277 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKBP12277 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKBP12277 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKBP12277 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKBP12277 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKBP12277 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CKBP12277 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CKBP12277 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CKBP12277 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CKBP12277 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKBP12277 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKBP12277 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKBP12277 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKBP12277 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms