Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG8P0DPA2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms