Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRCP08575 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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