Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF2P04141 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF2P04141 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSF2P04141 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSF2P04141 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSF2P04141 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF2P04141 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF2P04141 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms