Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL3A1P02461 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL3A1P02461 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms