Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms