Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX7O95931 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms