Protein–RNA interactions for Protein: O94868

FCHSD2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHSD2O94868 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCHSD2O94868 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCHSD2O94868 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms