Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF14O43557 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms