Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CRXO43186 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRXO43186 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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