Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms