Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD8O14715 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms