Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms