Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms