Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms