Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms