Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F8A0AVK6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms