Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM2AQ9Y2K7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM2AQ9Y2K7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms