Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP20Q9Y2K6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP20Q9Y2K6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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