Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms