Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms