Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms