Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms