Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms