Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms