Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms