Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms