Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXO40Q9UH90 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms