Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCF2Q9UG63 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms