Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT172Q9UG01 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms