Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms