Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms