Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFIP11Q9UBB9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms