Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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