Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms