Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSD3Q9NYI0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms