Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms