Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNNM1Q9NRU3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNNM1Q9NRU3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNNM1Q9NRU3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM1Q9NRU3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM1Q9NRU3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM1Q9NRU3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM1Q9NRU3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM1Q9NRU3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM1Q9NRU3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM1Q9NRU3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM1Q9NRU3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM1Q9NRU3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM1Q9NRU3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms