Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6CQ9HCJ0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms