Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms