Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms