Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms