Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms