Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP2Q9H2M9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms