Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms