Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms