Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX6-2Q9C056 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms