Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms