Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 WWOX-AS1-201ENST00000567099 443 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms