Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms